שיטת הקפאה של מוצרי מייבש הקפאה מחולקת בדרך כלל להקפאה מהירה בטמפרטורה נמוכה והקפאה איטית בטמפרטורה נמוכה.
הקפאה מהירה בטמפרטורה נמוכה (10 ~ 15 מעלות /דקה) מועילה להבטיח את האיכות. מיקרו-גבישים שנוצרו, הופעת המוצרים המתקבלים טובים, ומהירות הפירוק מהירה גם היא, אך היווצרות מיקרו-גבישים אינה תורמת להאיץ את מהירות ייבוש הקפאה.
הקפאה איטית בטמפרטורה נמוכה (מעלה /דקה) יוצרת גבישים גסים, מה שמועיל לשיפור היעילות של ייבוש הקפאה. עם זאת, הקפאה איטית של איכות מוצר כללי, במיוחד שיעור ההישרדות של אנזימים פעילים או וירוסים חיים, היא בחסד ביותר.
עבור תרופות סינתטיות, הדרישות להקפאה מהירה והקפאה איטית אינן מחמירות, ושתי השיטות מקובלות.
שיטת סובלימציה של מייבש הקפאה:
שיטת סובלימציה חד פעמית: באופן כללי, נקודת ההפצה המשותפת של המוצרים הרלוונטיים צריכה להיות סביב -10--20, והמבנה יחיד, הצמיגות והריכוז אינם גבוהים והמכשיר בעובי 10 מ"מ או בעובי 15 מ"מ. כל עוד הטמפרטורה של המוצר מורידה ל -10 תואר --21 מתחת לנקודת ההיתוך שלו, ניתן לחמם אותה ולסובלימציה. במהלך תהליך החימום והסובלימציה, יש לשלוט בקצב החימום כדי להבטיח שהמוצר יתייבש בהצלחה.
שיטת הקפאה וסובלימציה חוזרת ונשנית: מוצרים מסוימים עם נקודת הפצה נמוכה לא ניתן להקפיא לחלוטין אפילו בטמפרטורה נמוכה מאוד. מבחוץ, נראה שזה היה קפוא לחלוטין, אך בתהליך הסובלימציה, הבלוק הקפוא מתרכך לעתים קרובות, מייצר בועות ויוצר מבנה רשת צמיג על פני המוצר, המשפיע על התקדמות הסובלימציה והייבוש, כמו דבש, ג'לי מלכותי ומבני חומר אחרים. לעתים קרובות לא קל להקפיא מוצרים מורכבים וצמיגים, והמצבים שהוזכרו לעיל מופיעים בסובלימציה. ניתן לפתור אותו על ידי הקפאה חוזרת ונשנית. היישום של שיטה זו יכול להגדיל את יעילות ייבוש ההקפאה, לשפר את איכות המוצר ולקצר את מחזור ייבוש ההקפאה.
שיטת הקפאה וסובלימציה: בייבוש הקפאה, אם המוצר ארוז בצלחת גדולה, והעובי סמיך מדי או שהריכוז גבוה מדי, במהלך סובלימציה, אדי המים על פני השטח התחתון לא יכולים לברוח, מה שגורם לכל הבלוקים הקפואים לעיוות ונפרדים מתחתית הצלחת. חלק את המגש עם המוצר ושפר את יעילות העברת החום.